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牲畜兽医学报 2013
基于群体分化指数fst的绵羊全基因组选择信号检测, PP. 1891-1899 Keywords: 绵羊基因组,选择信号,候选基因,群体分化指数(fst) Abstract: ?本研究基于苏尼特羊(n=66)、德国肉用美利奴羊(n=159)和杜泊羊(n=93)3个群体的illuminaovinesnp50芯片分型数据,借助群体分化指数fst法进行群体间选择信号的检测分析,应用生物信息学方法分析寻找选择信号区域内的重要基因。结果,共找到343个“离群”位点,通过基因注释找到这些位点对应的365个候选基因。其中部分基因与绵羊生长、繁殖及肉质性状相关,如igf2pb3、igf1r、bmp2、bmpr1b、capn3等,本研究结果也进一步验证了前期利用cnv和gwas研究检测到的基因结果。通过go分析发现,这些基因主要富集在新陈代谢和去甲基化等条目。通过群体分化指数fst能有效地检测到具有选择信号的基因,其中包括绵羊部分重要经济性状的候选基因,研究结果能为绵羊的育种提供参考。
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