绵羊mc4r基因的半定量rt-pcr及生物信息学分析

？本研究旨在对绵羊mc4r基因进行组织表达谱和生物信息学分析。参考牛mc4r基因序列设计引物，采用pcr技术克隆绵羊mc4r基因序列，并利用半定量rt-pcr进行组织表达谱分析；同时对其进行生物信息学分析。结果表明，克隆的绵羊mc4r基因全长1919bp，含有999bp的完整cds编码区，编码332个氨基酸。其cds编码区的核苷酸序列与牛、人、猪、大鼠、小鼠mc4r基因对应序列的同源性分别为95.2%、68.8%、82.7%、76.6%、77.1%，预测的氨基酸序列同源性分别为97.0%、92.8%、93.7%、92.2%、91.6%。组织表达谱分析表明mc4r基因在各组织均不同程度的表达，其中在大脑表达量很高，其他组织较低。生物信息学预测mc4r蛋白功能发现,绵羊的mc4r蛋白存在7个跨膜螺旋结构域，同时预测mc4r存在10个磷酸化位点和1个特异性蛋白激酶磷酸化位点。结果表明，mc4r是一个非常保守的蛋白，在绵羊的生长发育中起着重要作用。