利用微卫星和snp标记信息进行奶牛亲子鉴定的模拟研究

？本研究旨在比较微卫星标记和单核苷酸多态（snp）标记进行奶牛亲子鉴定的效率。研究中随机模拟了10000对含微卫星或snp标记信息的非亲子关系的个体，用排除法进行亲子鉴定，该过程重复100次。结果表明，标记的多态性对于排除概率的影响最大。达到同样的排除概率，所需低多态标记数量远高于高多态标记。当真实母亲基因型已知时，个体父亲的推断效率较高。达到同样的排除概率，无论标记多态性高或低，3种鉴定类型所需snp标记数量均大于微卫星标记。当snp和微卫星标记的平均杂合度为0.484和0.875时，需要的snp标记数是微卫星标记的5～6倍；当snp和微卫星标记的平均杂合度为0.363和0.566时，需要的snp标记数约是微卫星标记的2倍。在2种标记中，达到同样排除概率（大于0.99），采用至少2个矛盾推断原则推断所需标记数为单个矛盾推断原则的1.45倍。结果表明，由于snp标记具有误判率低、重复性高和易于高通量自动化检测等特点，随着检测成本降低，snp标记将来完全有可能取代微卫星标记用于奶牛群体的亲子鉴定。