采用pcr-dgge技术分析蛋鸡肠道细菌种群结构及多样性

？利用基于16srdna的pcrdgge(变性梯度凝胶电泳)图谱技术结合特异性和共性条带割胶回收dna进行克隆和测序，对2、4、6和8周龄蛋鸡嗉囊、十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物细菌群落的结构和多样性进行了比较，并鉴定了8周龄蛋鸡部分特异性和共性群落成员，分析蛋鸡年龄和肠段部位对微生物群落结构和多样性的影响。肠道菌群dgge图谱显示肠道部位对细菌种群结构影响很大，盲肠内微生物的多样性最高，其次是回肠和空肠，嗉囊和十二指肠的微生物多样性比较低。十二指肠内细菌与其它肠段相比差异最大，其次是盲肠与其它肠段细菌组成的差异。随着蛋鸡周龄的增加，消化道微生物经历了由简单（2周）到复杂（4周），再回复简单（6周）到复杂（8周）的变化过程。dgge图谱中共性条带序列分析表明8周龄蛋鸡消化道前段的优势细菌是三得利乳杆菌（lactobacillussuntoryeus）、索氏梭菌（clostridiumsordellii）和大肠杆菌，盲肠中的特异性条带主要是各种不可培养的细菌以及超巨巨单胞菌（megamonashypermegale）和梭菌属细菌（clostridiumspp）。该研究结果表明蛋鸡肠道部位决定细菌群落的结构和多样性，蛋鸡的周龄影响肠道细菌多样性。