3株鸭肝炎病毒ⅰ型结构基因vp1的克隆及序列分析

？通过rtpcr方法扩增鸭肝炎病毒dhv1:161/79/v、yh、hn株的vp1基因的核苷酸序列。系统发育分析表明，3株病毒与已发表的dhv1结构基因vp1核苷酸和氨基酸的同源性分别为927%~969%和954%~966%，与dhv1变异株核苷酸和氨基酸序列的相似性均分别低于75%和88%，表明3株病毒属于dhv1，与变异株是不同的血清型。强毒dhv1:161/79/v的vp1蛋白第49和第183位氨基酸为t和h，弱毒dhv1:yh、hn为s和q，推测这2处位点的改变可能与病毒的强弱有关；dhv1和其变异株的vp1蛋白均没有保守的rgd序列；变异株ndhv:90d、04g在第50和51位比dhv1多2个氨基酸(q和d)，在第147和185位各缺失1个氨基酸(e和l)，而在变异株dhv:ap03337、ap04009、ap04114、ap04203的第145和146位比dhv1多了2个氨基酸（g、g）；不同血清型的鸭肝炎病毒在46-64位、95-149位、180-223位抗原指数差别较大，推测这些位点的改变可能影响病毒的生物学特性。