2006-2008年山东鸡传染性支气管炎病毒分离株s1与n基因的分子特征

？为了调查2006-2008年山东省鸡传染性支气管炎的分子流行病学特征，应用rtpcr方法分别扩增了14株传染性支气管炎病毒地方毒株s1基因和n基因，并进行了基因克隆与测序工作。对此14株病毒的s1基因序列利用限制性内切酶haeⅲ进行了限制性片段长度多态性(rflp)分析,结果显示可以将ibv毒株分为3种不同的基因型。其中11个毒株与lx4毒株有相同的rflp分型，2株病毒属于mass基因型，1个毒株有特异的rflp分型。并将这些分离毒株与11个参考毒株分别进行了基因与氨基酸系统进化树关系分析。s1基因分析结果显示将这些毒株分成3个基因型，与rflp分析的分型结果一致。11株病毒同属于lx4类型的毒株，分离毒株核苷酸序列相互之间有954%~997%的同源性。基因ⅱ型与疫苗株h120和m41的同源性很高。属于基因ⅲ型的1个毒株形成了独特的基因型。n基因分析结果表明：12株病毒与lx4属于同一基因型，有着较高的同源性。另2株病毒与疫苗株h120同源性很高。以上分析结果表明：山东省ibv分离株存在较为广泛的基因突变、插入和缺失，同时,ibv毒株间的基因重组也可能是山东省ibv变异株产生的另一主要原因。