猪shp基因外显子1单核苷酸多态性研究

？微小异源二聚体伴侣基因(smallheterodimerpartnergene，shp)主要在肝脏、心脏、胰脏和脂肪组织中表达，影响脂类在机体内的动态平衡。用pcr-sscp方法研究猪shp基因外显子1在5个猪群（长白猪、大白猪、皮特兰猪、金华猪和野猪）中的dna多态性，结果检测到3种基因型(gg、ga和aa)。χ2独立性检验结果表明，3种基因型频率分布在各品种间差异显著(p<0.05)。对纯合子个体测序检测发现，在shp基因第1外显子内存在一个多态位点（g374a，dq002896），且导致编码氨基酸由精氨酸（arg）替换为组氨酸（his）。对金华×皮特兰f2代资源家系猪进行了该多态片段的基因型鉴定，并分析了不同基因型对猪背膘厚和肌内脂肪含量的遗传效应，结果显示：aa基因型猪肩背膘厚、胸背膘厚、臀背膘厚以及肌内脂肪含量分别比gg基因型猪的低27.0%，30.6%，19.5%和40.9%(p<0.05)；aa基因型猪6～7肋背膘厚比ga基因型猪的低23.0%(p<0.05)。