用cpn60基因序列研究隐孢子虫种系发育关系

？本试验以编码线粒体功能性蛋白chaperonin60（cpn60）的核基因作为研究对象，对隐孢子虫分离株cpn60基因进行扩增测序，用clustalx1.81对扩增序列与genbank相关参考序列进行比对，然后用paup4.0程序中邻接法（neighbor-joining，nj）、最大简约法（parsimony,mp）构建基因树，同时用treepuzzle程序version4.1构建最大似然树（maximumlikelihood,ml），以确定不同隐孢子虫虫株之间的进化关系，并以18srrna和hsp70基因构建的进化树作参照，评价cpn60是否更适合作为隐孢子虫基因分型和进化关系的分子标记。结果显示：基于cpn60构建的进化树将隐孢子虫分为两大类：c.baileyi和c.meleagridis处于一个分枝，c.hominis、c.suis、c.parvum牛基因型和c.parvum鼠基因型处于另一个分枝上。不同隐孢子虫之间的同源性介于96％～100％，能有效区分隐孢子虫不同基因型。因此，cpn60基因序列也可作为隐孢子虫分离株种系发育的遗传标记。