猪rps3基因的克隆和表达分析

？rps3在体内具有多种功能，为了进一步揭示其结构与功能的关系，探索其编码区作为系统发育标记的可行性，本研究应用生物信息学、rt-pcr和3′-race方法首次克隆了猪rps3基因（genbank登录号：dq660373）并进行了序列分析，同时利用半定量rt-pcr方法分析了rps3基因的时空表达规律。序列分析表明rps3开放读码框全长为732bp，编码243个氨基酸残基的多肽链，含有核糖体蛋白s3标签，构建的系统发育树显示聚类结果与动物学上的分类一致。半定量rt-pcr分析表明rps3在所检测的10种组织中均有较高水平的表达，心脏中的表达量最高，肺脏中的表达量最低，其它组织间差异不大；在仔猪中表达量高，随着日龄的增加表达量不断下降，在3月龄以后的猪中表达量趋于平稳。以上结果说明rps3基因cds适合构建种间的系统发育树，mrna的表达水平与细胞的生长代谢速度有关。