中国黑白花奶牛干扰素-τ成熟蛋白基因的克隆与序列分析及牛干扰素-τ的分类

？通过pcr克隆测序首次测定了黑白花奶牛干扰素-τ成熟蛋白的完整基因序列（genbank登录号：dq680846、dq680847），其cds长度为519bp，编码含有172个氨基酸的牛干扰素-τ成熟蛋白。对所有牛干扰素-τ序列进行聚类分析，可将其聚为4类，发现了新的一类牛干扰素-τ（τ4）和6种新亚型（τ1e、τ3f、τ3g、τ3h、τ4a、τ4b）。dq680846属于τ4类的一种亚型，标记为τ4a；dq680847属于τ3类的一种亚型，标记为τ3f。各牛干扰素-τ基因核苷酸序列间的同源性在92.7%~99.8%之间，推导氨基酸序列间的同源性在88.5%~99.4%之间；τ4a、τ3f与其他牛干扰素-τ基因核苷酸序列间的同源性分别在94.0%~97.1%、92.9%~99.6%之间，推导氨基酸序列间的同源性分别在91.4%~96.0%、88.5%~99.4%之间。这一结果反应了牛干扰素-τ基因在进化过程中的高度保守性。二级结构预测发现牛干扰素-τ成熟蛋白是以5个α-螺旋（a-e螺旋）为基础构成的。asn78、cys1、cys29、cys99、cys139、ile143、lys160和c-末端的11个氨基酸为高度保守区，它们是维持牛干扰素-τ的结构和功能所必需的。