荷斯坦奶牛stat5a基因的snps检测及其与产奶性状的关联分析

？根据genbank公布的牛stat5a基因的2个snps（aj237937和af079568）的引物序列，采用pcr-sscp方法对758头中国荷斯坦奶牛进行了stat5a基因多态性检测，并将其与5个产奶性状进行了关联分析。在snp1的9501碱基处发现a→g突变；snp2中发现2个连锁点突变，即12440位t→c和12550位的cct插入/缺失；方差分析结果表明：snp1对乳蛋白率有显著影响（p<0.05）；snp2对产奶量有极显著影响（p<0.01），对乳脂量、乳蛋白量有显著影响（p<0.05）；单倍型组合对产奶量和乳蛋白量有极显著影响（p<0.01），对乳脂量有显著影响（p<0.05）。多重比较分析表明snp2的ab基因型的产奶量、乳脂量和乳蛋白量的最小二乘均数极显著（p<0.01）或显著（p<0.05）高于基因型aa；而单倍型组合h1h2的产奶量、乳脂量和乳蛋白量的最小二乘均数显著(p<0.05)或极显著(p<0.01)高于其它4种单倍型组合；h3h4对产奶量和乳蛋白量的效应极显著高于其它4种单倍型组合(p<0.01)。结果提示：stat5a基因可以作为奶牛产奶性状的候选分子遗传标记。