猪bpi基因部分csnps检测及其对蛋白结构功能的影响

？本试验以98头苏太猪为研究对象，检测bpi基因部分编码区的单核苷酸多态性（snps），并预测分析碱基突变对bpi蛋白结构和功能的影响。利用pcr-sscp和pcr-rflp结合测序的方法检测bpi基因外显子1、4和10的snps，运用生物信息学比较分析原蛋白和突变型蛋白的理化性质和结构。结果表明，以bpi基因cdna序列作为参照，bpi外显子1、4和10存在6个snps，3个同义突变（c.24a>g、c.54t>c和c.522c>t）和3个错义突变（c.433c>t(arg145trp)、c.1060a>g(thr354ala)和c.1151t>g(leu384arg)）。3种错义突变未改变bpi蛋白的理化性质、信号肽、跨膜区、糖基化位点以及二、三级结构，但是导致磷酸化位点的改变或存在其他潜在功能位点区域。westernblot试验发现，bpi蛋白的分子量为53ku，苏太猪f18大肠杆菌抗性型猪的bpi蛋白表达量显著高于敏感型猪。猪bpi外显子4和10的碱基突变不同程度影响到蛋白功能，并可能对机体疾病的抗性/易感性产生影响。