中国牛亚科家畜gh基因编码区序列的遗传变异研究

？采用pcr产物直接双向测序法，分段扩增普通牛、瘤牛、牦牛、大额牛和亚洲水牛共5个牛种的gh基因，并拼接成编码区全序列，分析中国牛亚科家畜不同牛种gh基因编码区序列变异及其分子进化特征。结果表明，牛gh基因编码区序列全长654bp，种间核苷酸突变率在0.1%~1.84%。5个牛种编码区序列定义了10种单倍型，瘤牛的单倍型多样性最高，大额牛和水牛均无单倍型多样性。gh基因编码区序列的密码子使用存在偏倚性，共发现了25个偏好性密码子。核苷酸的替代以转换为主，转换明显高于颠换，转换/颠换比为3.0。非同义突变位点远远少于同义突变位点，同义与非同义替代发生的速率比都小于或等于1，表明gh基因编码区序列不受达尔文正选择的影响。以gh基因单倍型序列为基础的分子进化树表明，水牛与普通牛、瘤牛、牦牛、大额牛间分化很明显；普通牛、瘤牛、牦牛、大额牛间序列分化并不明显，并且它们共同拥有一条相同的祖先核苷酸序列。说明中国牛亚科家畜gh基因编码区序列的变异相当贫乏，并且由于功能的约束表现得相当保守，进化速率相当缓慢。