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牲畜兽医学报 2015
绵羊肺炎支原体延伸因子tu基因的分子特性分析, PP. 288-294 Keywords: 绵羊肺炎支原体,tuf基因,克隆,分子特性,遗传进化 Abstract: ?对绵羊肺炎支原体(mycoplasmaovipneumoniae)参考菌株y98株和11个临床分离株的tuf基因进行克隆、测序,生物信息学分析及构建进化树,分析绵羊肺炎支原体tuf基因的分子结构特性。结果表明:y98株和11株分离株tuf基因编码区全长1209bp,编码402个氨基酸,氨基酸相似性为93.3%~100%,有较高的抗原指数和抗原表位,不含信号肽,平均gc含量为39.80%。y98株与10个分离株延伸因子tu存在1个跨膜区,含有6种不同的功能位点。而一分离株该蛋白质存在2个跨膜区,在271—274位点多出1个n-糖基化位点。12个菌株的tuf基因有117个单核苷酸突变位点,其中无义突变为41个,有义突变为76个,造成53个推导的氨基酸变化,主要发生在325—354位点靠近羧基端,有可能导致该蛋白质功能的改变。基于该基因的遗传进化与全基因组建立的进化关系一致,比16srrna基因更适合作为绵羊肺炎支原体进化关系的分子靶标。该基因种内保守同时也存在遗传多样性,作为分子分型的潜力值得进一步研究。
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