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牲畜兽医学报 2009
h1n2亚型猪流感病毒ha、np、na、m和ns基因的克隆与序列分析, PP. 221-227 Keywords: h1n2亚型siv,ha基因,np基因,na基因,m基因,ns基因,克隆,序列分析 Abstract: ?对3株h1n2亚型猪流感病毒(siv):sw/gx/17/05、sw/hn/1/05和sw/gx/13/06的血凝素(ha)、核蛋白(np)、神经氨酸酶(na)、基质蛋白(m)和非结构蛋白(ns)基因进行克隆和序列分析。结果显示:3株分离毒株ha、np、na、m和ns基因之间核苷酸同源性分别为91.3%~98.0%、98.4%~98.8%、97.4%~98.3%、98.8%~99.8%和98.1%~98.4%。遗传进化分析显示:分离毒株与美国分离的三源基因重排h1n2siv具有较近的亲缘关系;在ha、np、m和ns基因进化树中,3株分离毒株均位于古典h1n1亚型siv群,在na基因进化树中,3株分离毒株则位于人流感病毒群。ha和na基因推导氨基酸序列分别与代表毒株古典h1n1siva/swine/maryland/23239/1991(h1n1)和人h3n2流感病毒a/buenosaires/4459/96(h3n2)比较分析显示:ha(95.4%~96.1%)和na(96.6%~97.2%)具有较高的氨基酸同源性;糖基化位点、抗原位点和受体结合位点(ha)处氨基酸存在一定的差异,这些氨基酸差异对病毒生物学特性的影响有待于进一步研究。
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