5个重庆地方猪种遗传多样性的微卫星分析

？为了分析5个重庆地方猪种的遗传多样性和系统发生关系，采用fao-isag联合推荐的27个微卫星标记，以有效等位基因数、期望杂合度和多态信息含量等遗传参数为指标，评估了品种内遗传变异。计算了f统计量、nei氏遗传距离(da)和nei氏标准遗传距离(ds)并进行upgma和nj聚类分析及主成分分析，进而探讨了品种间的遗传分化和亲缘关系。结果，27个微卫星座位共检测到542个等位基因，其中43个等位基因为单一品种所特有。5个猪种的遗传多样性丰富：有效等位基因数(ne)在9.4933～11.0280之间,期望杂合度(he)在0.8897～0.9091之间，多态信息含量(pic)在0.8689～0.8926之间。f统计量分析表明，重庆地方猪种遗传分化明显（p＜0.001），各群体内存在一定程度的近交。2种聚类方法以nj法更为可靠。5个猪种聚为两类，荣昌猪、渠溪猪和合川猪为一类,罗盘山猪和盆周山地猪为一类。相关性分析表明，遗传距离与地理距离间无显著的相关（p>0.05）。该研究结果为重庆地方猪种的保护和利用提供了重要的理论依据。