禽流感病毒h9n2亚型西藏分离株ha和na基因的克隆与序列分析

？为了从分子水平上掌握西藏各地区h9亚型禽流感病毒的遗传进化情况及其与国内外h9亚型禽流感病毒的变异情况和流行规律之间的关系，作者选择了2009年不同时间从西藏部分地市养殖场分离的3株禽流感h9n2亚型毒株，采用rt-pcr技术对其ha和na基因进行扩增、克隆和测序，并对所得全序列进行同源性和遗传进化分析。结果显示，3株西藏分离病毒之间的ha和na基因变异程度不大，同源性达到98%以上，在遗传进化中均属于欧亚分支中的类bj/94亚分支，3株西藏分离毒的ha基因与bj/94的同源性在核苷酸水平为88.7%~88.8%,在氨基酸水平为93.4%~93.6%；na基因与bj/94的同源性在核苷酸水平为92.7%~93.0%，在氨基酸水平为93.4%~94.0%；3株西藏分离毒株可能与bj/94由同一毒株进化而来。由于基因突变使tb/1毒株的ha基因在313位出现了1个新的糖基化位点，tb/4毒株的na基因缺失了146位的糖基化位点；唾液酸吸附位点上有明显的突变；ha的裂解位点附近和na基因的受体结合位点区域内都有氨基酸突变。ha和na基因的变异可能与适应高原缺氧、高海拔等特殊气候环境有关。