基于表达谱芯片挖掘抗猪瘟病毒相关基因及其在不同猪瘟抗体水平下的表达差异

？本研究旨在筛选抗猪瘟病毒相关基因，并分析不同猪瘟抗体水平下这些相关基因在大白和长白猪中的表达差异。首先，基于表达谱芯片技术，采用agilent猪4×44k全基因组表达谱芯片，分析4组试验材料（病毒模拟物polyi:c转染的猪pk15细胞、甲基化酶抑制剂aza-cdr转染的pk15细胞、polyi:c及aza-cdr共同转染的pk15细胞、无处理的mock细胞），获得试验组间显著性差异表达基因。进而对差异表达基因进行聚类分析和geneontology（go）分析。结果表明，存在显著差异表达的抗粘液病基因（mx1）和双链rna依赖的蛋白激酶r基因（pkr）主要参与抗病毒相关的生物学过程。分析2个基因在不同猪瘟抗体水平下大白猪与长白猪外周血中的表达情况发现，2个基因在猪瘟高抗组中的表达量均显著高于未免疫组（p<0.05）。此外，mx1在猪瘟高抗组中的表达存在品种间差异，大白猪中的表达量极显著高于长白猪（p<0.01）。鉴于mx1和pkr基因都是干扰素通路中的重要基因，本研究结果提示，mx1和pkr基因可作为针对抗猪瘟病毒感染的重要候选基因。