牦牛aqp9基因cds全长序列克隆及其生物信息学特征分析

？为了研究高原动物对青藏高原极端生境的适应机理，并为探讨高原动物适应机制提供基本数据。本研究运用基因克隆技术对牦牛脑aqp9基因cds全长序列进行克隆，采用生物信息学方法进行分析，aqp9基因和编码序列特征进行了以下几方面的预测和分析：其物化性质、疏水性、跨膜结构和蛋白二级结构。结果表明，牦牛aqp9的cds含有一个885bp的开放阅读框，编码295个氨基酸；牦牛aqp9基因编码蛋白分子量和理论等电点分别为31.89ku和6.21，其编码蛋白含有6次跨膜结构，属于疏水性蛋白；二级结构由α-螺旋、延伸链、β-折叠及无规则卷曲构成；牦牛aqp9基因编码氨基酸序列与黄牛、藏羚羊、绵羊等物种间同源性较高，系统进化情况与其亲缘关系远近一致。本研究将为牦牛低氧适应性研究提供一定的基础资料。