关岭牛myodi基因启动子上转录因子结合位点的筛选

？本研究旨在筛选出关岭牛myodi基因启动子上的转录因子结合位点。根据genbank已公布的牛myodi基因的启动子序列，设计特异性pcr引物，扩增贵州关岭牛myodi基因的启动子区，构建重组克隆载体pucm-t-myodi-pro，并对阳性质粒进行测序鉴定。再利用筛选试验和生物信息学分析筛选出关岭牛myodi基因启动子上的转录因子结合位点。结果，筛选出关岭牛myodi基因启动子上含有的转录因子结合位点有satb1、xbp、mef2、pax-3、pbx1、ppar、tfⅱd、coup-tf、gfi-1、hnf-1、hox4c、nrf2(are)、mef1、rxr、smuc、snail、myod、vdr。结合在线软件分析和文献，最终筛选出关岭牛myodi基因启动子上含有myod、tfiid、pax3、mef1、vdr和mef2转录因子结合位点，这些转录因子对启动子活性起着重要的调控作用。结果显示，关岭牛myodi基因启动子上含有myod、tfiid、pax3、mef1、vdr和mef2转录因子结合位点。