传染性支气管炎病毒s1和n基因遗传变异频率的分析

？旨在探讨中国北方地区传染性支气管炎病毒（ibv）的流行和分子变异，进而探讨ibv的遗传演变规律。利用生物信息学方法对ibv纤突蛋白（s1）和核蛋白（n）编码基因进行分析比较。结果显示：2012—2013年发生在山东、天津等北方地区的ibv流行株高度同源，其s1基因核苷酸（氨基酸）相似性为94.0%~100%（93.1%~100%），n基因为98.4%~99.1%（98.1%~99.8%），而与经典疫苗株h120相似性均较低，且至少在s1基因的3个高变区产生了较多的点突变、缺失和插入，且变异集中在第53—150和250—290位，以高变区hvri居多，gm/13在62—65位缺失4个氨基酸。进一步的分析表明：ibv流行株s1基因与1998年在我国北方流行的a2株核苷酸相似性最高，为94.9%~97.2%，年核苷酸（nt）变异频率平均为2.4nt×10-3；而n基因则与lx4株相似性最高，为93.0%~93.5%，年变异频率平均为5.1nt×10-3。ibv流行株可能是a2-like和lx4-like毒株的重组，且n基因的变异频率明显高于s1基因。