基于高通量转录组测序的山羊睾丸和附睾头差异表达基因分析

？为探明山羊睾丸和附睾差异表达基因，挖掘与精子成熟和贮存密切相关的功能基因。采用illuminahiseqtm2000高通量转录组测序rna-seq技术对3只成年种公羊睾丸和附睾头进行测序，将组装得到的unigene比对到nr、go和kegg数据库中注释，并进行差异表达基因聚类分析。结果显示，睾丸和附睾头unigene总数分别为57727个和51395个，go功能分类注释到生物过程、分子功能和细胞组成数据库中的分别有25201、25456和27318个，其中差异表达基因数分别为9150、9172和10003个；注释到kegg通路中所有基因数23222个，其中差异表达基因数8219个，差异基因显著富集的信号通路：mrna监视通路和mtor信号通路；睾丸和附睾头中差异表达的基因共有24592个，其中上调基因有8420个，下调基因有16172个。在附睾头中上调幅度最大的前3位：gdefb124、gdefb109和gdefb108，下调幅度最大的前3位：gtsf1l、srrm1和fndc8。附睾头中表达量最高的前3位基因依次为lcn5、gdefb124和gpx5。睾丸中表达的基因数量大于附睾头中数量；β防御素家族、lipocalin家族和gpx5可能在附睾头精子成熟、贮存和受精中发挥重要作用。