湘西黄牛myf5和pax7基因的snps检测及其与体尺性状的关联分析

？本研究旨在检测湘西黄牛myf5和pax7基因的单核苷酸多态性(snp)，探讨湘西黄牛多态性位点的群体遗传特征，寻找与生长发育相关的分子标记。采用pcr和直接测序技术筛查湘西黄牛myf5基因第2内含子和pax7基因第3外显子的snps；以217头湘西黄牛为研究对象，采用pcr-rflp方法对群体进行遗传多态性分析，运用最小二乘线性模型进行基因型与体尺性状的关联分析。结果表明，在湘西黄牛myf5基因第2内含子中检测到9个snps，其中7个是本研究新发现的snps；在pax7基因第3外显子检测到1个snp。群体遗传多态性分析结果显示，湘西黄牛群体中myf5基因g.1948a>g位点的aa、ag和gg基因型频率分别为0.0461、0.2350和0.7189；a和g等位基因频率分别为0.1636和0.8364。pax7基因g.31g>a位点只检测到ag和gg2种基因型，基因型频率分别为0.0737和0.9263；a和g等位基因频率分别为0.0369和0.9631。这2个位点均处于低度多态，且达到了hardy-weinberg平衡状态(p>0.05)。关联分析结果表明，myf5基因g.1948a>g位点的aa和ag型个体的体重显著高于gg型个体的体重(p<0.05)，a等位基因对体重为正效应；而各基因型间的体高、体长和胸围的差异均不显著(p>0.05)。结果提示，湘西黄牛myf5基因的snp位点较多，g.1948a>g位点可能为湘西黄牛体重性状的分子遗传标记位点。