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解放军医学杂志 2010
人ID4基因启动子及上游顺式表达调控元件的克隆及特征分析, PP. 151-154 Keywords: ID4蛋白,人,转录启动子,人工基因融合,计算生物学 Abstract: 目的?克隆人ID4基因启动子及上游顺式调控元件,并对其结构及调控元件的特征进行生物信息学分析。方法??从?NCBI人类基因组数据库中截取ID4基因转录起始位点上游5′侧翼区约2242bp及下游5′非翻译区212bp的基因组序列。利用TESS?和Genomax等在线分析软件进行启动子及上游调控元件的特征分析。设计PCR引物,采用分段扩增法,获得长度分别为1811bp和?650bp的两条产物片段,分别插入pGEM-T载体,转化至Top10感受态大肠埃希菌,筛选阳性克隆。先后应用KpnⅠ/NheⅠ、KpnⅠ/??EcoRⅠ对获得的两个pGEM-T重组载体及pGL???3???Basic荧光素酶报告载体进行双酶切,T???4???DNA连接酶连接,转化至Top10感受态大?肠埃希菌,筛选阳性克隆,最后测序鉴定。结果??获得长度为2461bp的ID4基因启动子DNA序列,经测序证实与人类基因组序列一?致。ID4基因具有Ⅱ型启动子特征,有2个非常显著的上游元件(TATA盒和GC盒),GC含量占总碱基含量的65.9%。在转录起始?位点上游-1000bp与下游212bp之间分别存在多个可能具有正向和负向调控作用的顺式元件。结论??成功克隆了人ID4基因启动?子及其顺式调控元件,并证明ID4基因具有典型的Ⅱ型启动子结构。筛选出3个最有可能对ID4表达起调控作用的顺式元件,分别为?糖皮质激素受体、单磷酸腺苷(cAMP)结合蛋白受体及雌激素受体。
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