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ISSN: 2333-9721
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应用PCR-DGGE技术研究石莼、网地藻藻际微生物多样性

DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2014.12.012, PP. 73-77

Keywords: 变形凝胶梯度电泳(PCR-DGGE),石莼,网地藻,藻际微生物,微生物多样性

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Abstract:

应用变性凝胶梯度电泳(PCR-DGGE)技术对石莼、网地藻藻际微生物多样性进行研究,并对其进行相似性、未加权聚类分析(UPGMA)及微生物多样性(Shannon)指数分析。结果表明,PCR-DGGE图谱显示,石莼、网地藻藻际微生物DGGE图谱有着明显的差异性,具体表现在条带数及密度值的不同。Quantityone图谱分析表明:石莼藻际微生物16SrRNA基因的V3区共分离得到25条DNA片段,网地藻为16条DNA片段。DGGE相似性及未加权聚类分析表明:网地藻藻际微生物间的相似性为77.78%,石莼藻际微生物细菌群落间的相似性为49.25%。Shannon指数分析表明,石莼藻际微生物多样性指数显著高于网地藻(P<0.05)。石莼藻际微生物细菌群落较网地藻丰富。

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