两种鯻科鱼类线粒体16SrRNA基因片段序列分析

利用PCR技术成功扩增了高体革鯻(Scortumbarcoo)和厚唇弱棘鯻(Hephaestusfuliginosus)的线粒体16SrRNA基因序列。通过序列测定,得到791bp的基因片段,碱基A、T、G、C平均含量分别为31.4%、21.2%、20.5%和26.9%,序列中的A+T含量明显高于G+C的含量,这与其他鱼类的16SrRNA基因片段研究结果相一致。通过序列分析发现,高体革鯻和厚唇弱棘鯻两序列共存在23处碱基变异,其中碱基转换位点20个,碱基颠换位点3个,转换与颠换比率为6.7,没有发现碱基插入与缺失。与从GenBank中查到的3种鯻科鱼类的同源序列比对,邻接法(neighbor-joining)构建亲缘关系树,结果显示,5种鯻科鱼类聚在一起,分为独立的2支,匀鯻和单色匀鯻及花身鯻聚成1支,高体革鯻和厚唇弱棘鯻聚为1支,说明高体革鯻与厚唇弱棘鯻的亲缘关系比较近,而与其他另外3种鯻科鱼类亲缘关系比较远。