下一代测序技术数据中的选择性剪切计算识别方法研究

随着测序技术的发展,下一代测序技术(Next-GenerationSequencing)给生物信息学领域研究带来了新的机遇和挑战.由于选择性剪切(alternativesplicing,AS)在真核生物基因表达和蛋白质多样性方面的重要性,识别选择性剪切位点一直都是研究的重点.下一代测序技术的出现,使得选择性剪切研究的计算方法不断地变化.介绍了选择性剪切过去和目前研究的状况,然后总结了基于RNA-seq数据的选择性剪切研究方法、软件以及数据库,并利用了RNA-seq数据比较了相关软件,最后讨论了选择性剪切中计算方法的发展方向和前景.