南江黄羊,IGFBP-5基因,克隆,生物信息学分析, Open Access Library" />
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河南农业科学 2011
山羊IGFBP-5基因克隆及特征分析, PP. 132-137 Keywords: 南江黄羊&searchField=keyword">南江黄羊')"href="#">南江黄羊,IGFBP-5基因,克隆,生物信息学分析 Abstract: 为探讨山羊IGFBP-5基因的特点,进一步研究其在山羊上的表达及生长发育中的作用机制,以初生南江黄羊肝脏组织为材料抽提RNA进行克隆测序,并利用ExPasy、NetPhos、NetO-Glyc、SignalP等生物软件分析IGFBP-5基因CDS区及其编码氨基酸的理化性质、结构特点。结果显示,山羊IGFBP-5基因的CDS全长819bp,编码272个氨基酸残基,相对分子量为30.392kD,理论等电点pI=8.56,开始19个氨基酸残基构成信号肽,具有2个疏水区、5个亲水区且总平均疏水性值为-0.619,成熟肽定位于细胞外。二级结构以无规卷曲为主(83.8%),α-螺旋和延伸片段分别为13.6%和2.6%。N-端存在IGFBP信号,C-端有Ⅰ型甲状腺球蛋白结构域,发现3个O-糖基化位点,22个磷酸化位点,主要磷酸化方式有CKⅡ、PKA、PKC、MAPK4种。山羊与其他物种IGFBP-5基因mRNA及氨基酸序列一致性分别在89%和94%以上,其N-端在几个物种中完全一致。山羊和人IGFBP-5蛋白前体分别有特异性的氨基酸插入(Ala102、Leu3)。山羊IGFBP-5蛋白是位于细胞外且具有信号肽的弱亲水性分泌蛋白,磷酸化是调控其功能的主要因素。
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