利用数字基因表达谱对鸡卵泡发育相关基因的筛选

为筛选禽类卵泡募集、等级化维持及排卵过程中的关键基因,通过数字基因表达谱检测鸡卵巢内等级前小白卵泡(SWF)和发育到最大期的等级卵泡(F1)中的差异表达基因。结果显示,随着卵泡的成熟,显著上调表达的基因有784个,显著下调的基因有1526个。基因表达差异倍数达到5倍以上的上调基因包括PTGS1、TEK、VEGF-A、MMP-3、CDK1等;下调基因包括β-catenin、ZO-1、Nectin-3、PTPX15、Gadd45等。对差异表达基因进行基因本体(GO)生物学分析和信号通路显著富集分析发现,差异表达的基因所编码的蛋白主要参与生物学催化反应、分子连接、转移酶活性、水解等生物学过程;主要与细胞黏合通路、p53信号通路、蛋白合成通路及细胞周期通路等信号通路有关。对卵泡发育过程中的基质金属蛋白酶家族(MMPs)的MMP-3与MMP-9基因表达变化进行测定发现,MMP-3基因表达量在卵泡发育过程中显著升高,排卵后的卵泡中显著下降;MMP-9基因表达量则持续显著升高,在排卵后第2天的卵泡中下降,但下降不明显。