不同物种Mchr1基因编码区生物信息学分析

采用比较基因组学和生物信息学的方法分析了人、黑猩猩、玻利维亚灰鼠猴、猕猴、蒙眼貂、裸鼢鼠、佛罗里达海牛、小家鼠、小马岛猬共9个物种的黑色素浓集激素受体1(Mchr1)基因编码区(CDS)的遗传多样性，并对其氨基酸序列、蛋白结构等进行预测。结果表明，来自9个物种的44个Mchr1基因序列中共检测到多态位点200个，其中单一多态位点81个，单倍型14种，Mchr1基因CDS在种内表现较为保守，种间则表现出较丰富的遗传多样性。Mchr1蛋白为疏水性蛋白，理论等电点均大于7，肽链的不稳定系数介于36.26~44.21，均较稳定。Mchr1蛋白位于细胞质中。