不同物种Hsf2基因编码区生物信息分析

采用比较基因组学和生物信息学方法,分析了人、黑猩猩、长臂猿、猕猴、狨、欧洲兔、大熊猫、野猪、牛、非洲象、褐家鼠、小家鼠、荷兰猪和灰仓鼠共14个物种的热休克转录因子2(或称热激因子2,heatshocktranscriptionfactor2,HSF2)基因编码区(CDS)的遗传多样性,并对该基因的氨基酸序列、组成成分等进行预测和推断。结果表明,在来自14个物种的40条基因序列中共检测到多态位点数203个,其中有单一多态位点68个,百分率约为9.81%,检测到单体型17种,Hsf2基因CDS在种内表现较为保守,种间则表现有较丰富的遗传多样性。Hsf2的氨基酸序列表现为亲水性,理论等电点大多小于7,表现为酸性;肽链的不稳定系数在51.90～58.13,表明多肽不稳定。