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海洋通报 2014
基于紫贻贝Mytilusgalloprovincialis表达序列的核受体家族分析DOI: 10.11840/j.issn.1001-6392.2014.02.009, PP. 174-179 Keywords: 紫贻贝,核受体(核激素受体),多序列比对,贝叶斯推断法 Abstract: 核受体家族是多细胞动物功能多样并且重要的基因家族。本研究通过对紫贻贝Mytilusgalloprovincialis公共数据库表达序列的整合分析,共获得29条核受体序列。通过DNA结合结构域(DBD)和配体结合结构域(LBD)的多序列比对,并采用贝叶斯推断法进行系统进化分析,推测其中19个核受体属于NR1亚家族,5个属于NR2亚家族,2个属于NR3亚家族,1个属于NR5亚家族。结果表明紫贻贝中存在HR96、E75、ROR、HNF4、RXR、TLL、SVP、ESR、ERR同源的核受体,并且具有新型的2DBD核受体。
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