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中间球海胆群体遗传学研究中AFLP引物数量及样本量的选择
DOI: 10.11840/j.issn.1001-6392.2012.1.010
Keywords: 中间球海胆 ,AFLP标记 ,样本量 ,群体遗传学
Abstract:
本研究采用10,20,30,40,50,60,70,80共八个样本量梯度，随机选择并逐步增加AFLP引物组合，研究了AFLP标记数量及样本量对中间球海胆(Strongylocentrotusintermedius)群体遗传学指标的影响。结果表明：基因多样性指数（H）、Shannon氏指数（I）和多态位点比例（PP）三个遗传学指标对样本量的敏感程度不同，PP指标受样本量影响较大，样本量≧50个时方稳定，H指标在样本量≧30时稳定下来，而I指标在样本量≧20时即不再出现显著差异。共采用6对AFLP引物对80只海胆进行群体遗传学研究。通过每一对、每两对、每三对、每四对、每五对引物组合分别计算各遗传学指标，发现前二者所得各值之间以及其与对照值（6对引物所得值）之间存在显著差异，而每三对引物组合计算的各指标间不存在显著差异。据此推测，对中间球海胆进行AFLP标记研究中，样本数量最好不少于50个；而若样本量足够大（80个个体），则至少需要3对AFLP引物（或不少于100个标记），方能对海胆群体进行准确的遗传学评价。
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