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华南农业大学学报 2007
猪泛素C端水解酶L1基因的克隆与序列分析DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.2007.01.024, PP. 100-104 Keywords: 猪,泛素C端水解酶L1(UCH_L1)基因,电子延伸,基因序列分析,水解酶,基因,克隆与序列分析,Gene,Hydrolase,Ubiquitin,SequenceAnalysis,登录号,命名,蛋白家族,磷酸化,保守结构域,存在,信号肽,区域,疏水性,预测显示,结构和功能,编码蛋白,序列同源性 Abstract: 从人泛素C端水解酶L1(UCH_L1)基因出发,在dbEST数据库中同源搜索,找到1条与人UCH_L1基因编码氨基酸同源性较高且在香猪背最长肌中表达的EST(BM194679).通过电子克隆和进一步RT-PCR试验验证,获得猪UCH_L1基因全长cDNA序列,其全长1105bp,开放阅读框(ORF)位于60～728bp,编码223个氨基酸.同源性分析结果表明,与人、鼠UCH_L1基因cDNA编码区(CDS)同源性分别为91.2%和86.5%,蛋白质序列同源性均为96.6%.对该基因编码蛋白的结构和功能预测显示含有2个典型的疏水性区域,不含有信号肽,存在1个UCH_L1(pfam01088)保守结构域和多个磷酸化位点,属UCH_L1蛋白家族,故将该基因命名为猪泛素C端水解酶L1基因(登录号AY495532).
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