鸡pATGL基因的电子克隆及比较基因组分析

利用生物信息学和比较基因组学方法对鸡pATGL(predictedadiposetriglyceridelipase)基因的结构、表达和功能进行了分析,结果表明:(1)电子克隆获得的鸡pATGL基因cDNA全长1788bp,包括1452bp的编码区和5'UTR(70bp)、3'UTR(266bp),编码合成483个氨基酸的多肽;(2)鸡pATGL基因全长在30kb以上,包含9个外显子和8个内含子,其中内含子1(约20kb)远远长于其他区域;(3)鸡pATGL蛋白的相对分子质量为53600,不含信号肽,具有GXSXG(氨基乙酸-X-丝氨酸-X-氨基乙酸)脂肪酶活性结构和Patatin结构域,可能存在5个N端朝内的跨膜螺旋结构;(4)基于cDNA及EST数据库的检索显示,鸡pATGL基因在腹脂、胸腺、黏液囊、脾、骨髓、垂体、下丘脑和松果腺、心脏、软骨组织、小脑、卵巢乃至胚胎等组织中表达;(5)鸡pATGL基因与CD151、RPLP2位于5号染色体的紧密连锁群,这种连锁关系与人、小鼠以及狗紧密一致.