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ISSN: 2333-9721
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框镜鲤维氏气单胞菌CY0806株鞭毛flaA基因的克隆与生物信息学分析

DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.2012.01.019, PP. 92-95

Keywords: 框镜鲤,维氏气单胞菌,flaA基因,生物信息学

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Abstract:

以框镜鲤Cyprinuscarpio维氏气单胞菌AeromonasveroniiCY0806株细菌基因组DNA为模板,经PCR扩增,获得flaA基因,将其克隆并测序,测序结果与气单胞菌属的不同菌株进行相似性分析,并对flaA基因编码蛋白质进行生物信息学分析。结果显示:获得框镜鲤维氏气单胞菌鞭毛flaA基因,长915bp,编码304个氨基酸,系统进化树分析,其与其他维氏气单胞菌flaA基因处于同一分支,相关生物信息学分析显示,flaA基因编码的蛋白质相对分子质量32098.66,等电点5.57,半衰期30h,不稳定系数为32.31,脂肪系数81.05,不存在信号肽和跨膜区,二级结构预测:flaA基因以α螺旋和β折叠为主,同时,以同源建模法预测了flaA基因编码蛋白的三维立体结构。

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