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河北省马铃薯S病毒株系的分子鉴定研究
DOI: 10.3321/j.issn:1000-7091.2007.03.010
Keywords: 马铃薯S病毒 ,外壳蛋白基因(CP) ,序列分析 ,株系鉴定
Abstract:
对张家口分离的马铃薯S病毒(PotatovirusS，PVS-Hebei)的CP基因进行了克隆和序列分析。以提纯的马铃薯植物总RNA为模板，应用RT-PCR技术扩增目的基因，PCR扩增产物克隆到质粒pMD18-T上，并进行了序列分析。结果表明，克隆的cDNA片段由885个核苷酸组成，编码294个氨基酸组成的33kD蛋白，与PVS外壳蛋白的大小一致，与国际基因库登记的几个株系相比，结果表明，PVS-Hebei与它们之间的核苷酸序列同源性为82.4%～95.6%，氨基酸序列的同源性为93.9%～98.0%，进化树分析表明，PVS明显存在2个组(组Ⅰ和组Ⅱ)，PVS-Hebei归类为Ⅰ组，与来自组Ⅰ的欧洲普通株系(PVS-Uk)的亲缘性要比来自组Ⅱ北美的Andean株系(PVS-A)株系的亲缘性要近。
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