地方品种固始鸭γ-干扰素基因的克隆与分子进化分析

根据GenBank发表的鸭γ-干扰素cDNA基因序列，自行设计、合成1对引物，应用RT-PCR技术，无需用非特异性免疫原如ConA、PHA等刺激分离的脾淋巴细胞，直接提取总RNA，扩增固始鸭γ-干扰素基因(DuIFN-γ)，并进行克隆和测序。测序结果表明，获得了DuIFN-γ全序列，其大小为515bp，包含一个完整阅读框，编码164个氨基酸残基，推导的氨基酸有3个潜在的N-糖基化位点，有5个与二硫键形成有关的半胱氨酸。序列比较分析发现，克隆的固始鸭IFN-γ基因序列与GenBank中4条鸭IFN-γ基因序列中的3条序列(AF087134，AF100929，AJ012254)完全一致，而与另一条北京鸭核苷酸同源性为99.6%，有2个碱基发生非同义变异，氨基酸同源性为98.8%。固始鸭与人和其他种动物的IFN-γ基因序列分析和系统进化分析表明，IFN-γ基因存在种属的差异性，亲缘关系越近，同源性越高。DuIFN-γ基因的成功克隆为进一步研究固始鸭IFN-γ基因表达、生物学活性和应用奠定基础。