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ISSN: 2333-9721
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FMDVAsia1/HeB病毒株结构蛋白基因的克隆测序及B细胞抗原表位预测

DOI: 10.7668/hbnxb.2009.04.012, PP. 57-63

Keywords: 口蹄疫病毒,结构蛋白,测序,B细胞表位

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Abstract:

对口蹄疫病毒Asia1/HeB株P1结构蛋白基因进行了扩增、克隆及序列测定.采用DNAStarProtean软件对P1蛋白的二级结构、可塑性、亲水性、表面可及性及抗原指数等参数进行分析,综合预测其B细胞表位分布.结果表明,FMDVAsiaI/HeB株P1基因长2199bp,包含完整的开放阅读框,编码33个氨基酸,其中VP1长633bp,编码211个氨基酸,VP2长654bp,编码218个氨基酸,VP3长65bp,编码219个氨基酸,VP4长255bp,编码85个氨基酸.P1结构蛋白的二级结构较为复杂,含有较多的β片层结构和转角结构,VP1、VP2和VP3上均有多个区域为B细胞优势表位,VP4上也有少量的潜在B细胞表位.与已鉴定的B细胞表位相比较,该方法预测的结果有较高的准确度.为试验确定FMDVAsiaI/HeB株P1结构蛋白的B细胞表位和反向疫苗学设计提供了理论基础.

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