全部 标题 作者
关键词 摘要

OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
费用:99美元

查看量下载量

相关文章

更多...

菜用大黄SRAP-PCR反应体系的优化及验证

DOI: 10.7668/hbnxb.2014.04.017, PP. 105-110

Keywords: 菜用大黄,SRAP-PCR,体系优化

Full-Text   Cite this paper   Add to My Lib

Abstract:

为建立菜用大黄最佳的SRAP反应体系,进一步对菜用大黄品种进行遗传多样性分析,以菜用大黄基因组DNA为模板,采用单因素与正交设计相结合的方法,对SRAP-PCR扩增体系中的模板DNA、Mg2+、dNTPs、引物和TaqDNA聚合酶浓度5个因素进行优化,并确立菜用大黄SRAP-PCR的最佳体系。结果表明:菜用大黄各因素对反应体系影响大小依次为:引物浓度>Mg2+浓度>dNTPs浓度>TaqDNA聚合酶浓度>DNA用量;最佳反应体系为:25μL反应体系中含10×PCRBuffer2.50μL、模板DNA30ng、Mg2+2.50mmol/L、dNTPs0.25mmol/L、TaqDNA聚合酶0.04U/μL、上下游引物各0.5μmol/L。用8个菜用大黄品种DNA样品对优化的反应体系进行验证,均获得了条带清晰且多态性较好的扩增图谱,证实了该体系的稳定性和可靠性,可用于菜用大黄的遗传多样性分析。

References

[1]  Zhao Y P.Somaclonal variation and crop failure of micro-propagated rhubarb[D].UK:University of Essex,2004.
[2]  Rubatzky V E,Yamaguchi M.World vegetable:principles,production and nutritive values[M].New York:Second edution,Chapman & Hal1,1997:692-695.
[3]  王健梅.奥运蔬菜系列——叶蔬类[J].中国农业信息,2006(2):7.
[4]  Li G,Quiros C F.Sequence-related amplified polymorphism(SRAP),a new marker system based on a simple PCR reaction:its application to mapping and gene tagging in Brassica [J].Theoretical and Applied Genetics,2001,103(2/3):455-461.
[5]  张安世,邢智峰,韦慧彦,等.苔藓植物SRAP反应体系的优化[J].河南农业科学,2009(11):108-111.
[6]  于辉,张延辉,帕提古丽,等.基于SRAP标记对新疆狗牙根遗传多样性的研究[J].新疆农业大学学报,2013,36(2):124-130.
[7]  齐兰,王效宁,张吉贞,等.利用SRAP标记研究海南野生稻的遗传多样性与遗传分化[J].植物遗传资源学报,2013,14(3):402-406.
[8]  李齐向,华树妹,雷伏贵,等.ISSR和SRAP在山药遗传多样性分析上的应用比较[J].福建农业学报,2013,28(9):876-883.
[9]  陈大霞,李隆云,钟国跃,等.用SRAP标记分析正品大黄的遗传关系[J].中国中药杂志,2008,33(20):2309-2312.
[10]  Liu L,Guo W,Zhu X,et al.Inheritance and fine mapping of fertility restoration for cytoplasmic male sterility in Gossypium hirsutum L.[J].Theoretical and Applied Genetics,2003,106(3):461-469.
[11]  陈万胜,王元英,罗成刚,等.利用正交设计优化烟草SRAP反应体系[J].分子植物育种,2008,6(1):177-182.
[12]  袁菊红,权俊萍,胡绵好,等.石蒜SRAP-PCR扩增体系的建立与优化[J].植物资源与环境学报,2007,16(4):1-6.
[13]  何正文,刘运生,陈立华,等.正交设计直观分析法优化PCR条件[J].湖南医科大学学报,1998,23(4):76-77.
[14]  邵清松,郭巧生,房海灵.药用菊花SRAP-PCR反应体系的优化[J].核农学报,2009,23(5):820-824.
[15]  陈莉娉,张小平,李晓红.青檀SRAP-PCR体系优化设计方案[J].生物学杂志,2012,29(5):87-91.
[16]  郝丽芬,宋培玲,李子钦,等.油菜黑胫病菌ISSR-PCR反应体系优化[J].华北农学报,2013,28(4):204-207.
[17]  梁爽,原玉香,张晓伟,等.大白菜InDel-PCR反应体系的优化[J].河南农业科学,2012,41(9):110-113.
[18]  郭彩杰,侯丽霞,崔娜,等.利用正交设计优化番茄SRAP-PCR反应体系[J].中国蔬菜,2011(2):48-52.
[19]  昝逢刚,刘家勇,赵俊,等.利用正交设计优化甘蔗SRAP-PCR反应体系[J].中国糖料,2011(3):6-8.
[20]  Guo D L,Luo Z R.Genetic relationships of some PCNA persimmons(Diospyros kaki Thunb)from China and Japan revealed by SRAP analysis[J].Genetic Resources and Crop Evolution,2006,53(8):1597-1603.
[21]  张飞,陈发棣,房伟民,等.菊花SRAP-PCR反应体系的优化与确立[J].植物资源与环境学报,2009,18(3):44-49.
[22]  孙祖霞,刘兆磊,陈素梅,等.荷花SRAP-PCR反应体系的优化与确立[J].南京农业大学学报,2011,34(6):53-58.
[23]  张婷,吕明治,董妍玲,等.油茶SRAP-PCR反应体系的建立与引物筛选[J].安徽农业科学,2010,38(17):8882-8885.
[24]  荆赞革,唐征,张小玲,等.青花菜SRAP-PCR体系优化与品种分子鉴定[J].生物技术通报,2010(12):122-125.
[25]  卢莉,赵一鹏.菜用大黄的研究进展[J].广东农业科学,2008(2):19-21,27.
[26]  于翠.基于SRAP分子标记的安祖花遗传连锁图谱构建[D].北京:中国农业科学院,2012.
[27]  孙丽丹.梅花遗传连锁图谱构建和表型性状QTLs分析[D].北京:北京林业大学,2013.
[28]  琴亚丽.猪苓遗传多样性及多糖合成酶-UGPase基因的克隆[D].杨凌:西北农林科技大学,2012.
[29]  Persson H A,Rumpune,Mollerstedt L K.Identification of culinary rhubarb (Rheum spp.)cultivars using morphological characterization and RAPD markers[J].Horticultural Sciences & Biotechnology,2000,75:684-689.

Full-Text

Contact Us

service@oalib.com

QQ:3279437679

WhatsApp +8615387084133