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ISSN: 2333-9721
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猪繁殖与呼吸综合征病毒Shanxi-6株全基因序列分析

DOI: 10.7668/hbnxb.2014.02.011, PP. 62-65

Keywords: 猪繁殖与呼吸综合征病毒,基因组,序列分析

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Abstract:

采用RT-PCR方法,分段扩增出猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)Shanxi-6株15个基因片段,并将这15个片段分别连接到pMD18-T载体上进行克隆测序、拼接后,得到PRRSVShanxi-6株全基因组长15320bp(不包含PolyA尾),包含9个开放阅读框,5’UTR长189bp,3’UTR长150bp。基因组序列分析结果表明,Shanxi-6株与欧洲型代表毒株LV的核苷酸序列同源性为54.35%,与美洲型代表毒株VR-2332的核苷酸序列同源性为88.80%,与HPPRRSV毒株(JXA1、HUN4、HuN、HUB1)亲缘关系最近,核苷酸序列同源性高达97.44%~97.74%,且在非结构蛋白Nsp2上有30个氨基酸的缺失。

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