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ISSN: 2333-9721
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FMDVOA/58病毒株VP3蛋白结构的模拟与分析

DOI: 10.7668/hbnxb.2008.06.006, PP. 28-31

Keywords: 口蹄疫病毒,VP3蛋白,同源模建

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Abstract:

以口蹄疫病毒株OA/58RNA为模板,反转录并扩增目的cDNA,然后与pMD18-T载体连接并转化JM109菌株,提取的重组质粒用凝胶电泳、PCR和BamHI、HindIII双酶切法鉴定。分析表明,口蹄疫病毒VP1、VP2、VP3和VP在核苷酸水平上的变异率是无差异的(p>0.05);而它们在氨基酸水平上的变异率差异显著(p<0.05)。该毒株与20株源于GenBank中的VP3氨基酸序列比较发现其保守区主要位于第1~2、26~35、37~3、5~57、61~122、12~173、175~209、211~220位。运用同源模建,OA/58VP3蛋白三维空间结构可分为A,B,C3个结构区域。保守区氨基酸残基在维持VP3蛋白的空间构象和功能方面具有重要作用。

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