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ISSN: 2333-9721
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基于叶绿体DNAtrnL-F序列研究部分鸢尾属的亲缘关系

DOI: 10.7668/hbnxb.2010.05.023, PP. 112-116

Keywords: 鸢尾属,亲缘关系,叶绿体DNA(cpDNA),trnL-F序列

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Abstract:

利用通用引物,采用PCR技术从24个鸢尾样品中扩增了叶绿体基因组trnL-F间隔区的DNA片段,进行了序列测定,序列长度为1003~1113bp,比较长度为94bp,其中共有92个位点发生了单个碱基的置换,14个位点发生了缺失,因此有进化意义的位点共106个,约占总序列比较长度的11.11%.运用DNAMAN软件分析了这些鸢尾的亲缘关系,可分为2个相对独立的大组.第一大组可以分为2组:3个种源马蔺关系很近形成一组,粗根鸢尾、溪荪和喜盐鸢尾聚成一组.第二大组也分为2组:6个种源的马蔺与野鸢尾聚在一起,再和小鸢尾聚成一组;3个种源的鸢尾、高原鸢尾、德国鸢尾、矮鸢尾、野鸢尾、扇形鸢尾、红籽鸢尾和I.ungiucularis聚成一组.

References

[1]  中国科学院中国植物志编辑委员会.中国植物志[M].第16卷,第1分册.北京:科学出版社,1985.
[2]  刘云.吉林省八种鸢尾植物的RAPD分析及结构植物学分析[D].哈尔滨:东北师范大学,2001:45.
[3]  黄芸,杨光.RAPD法鉴定射干类中药[J].中草药,2002,33(10):935-937.
[4]  秦民坚,黄芸,杨光,等.射干及类似药用植物叶绿体rbcL基因序列分析[J].药学学报,2003,38(2):147-152.
[5]  胡金勇,曾英,桑玉英.双向电泳分析鸢尾绿白嵌合叶片的蛋白质[J].云南植物研究,2002,24(3):387-391.
[6]  Felsenstein J.Confidence limits on phylogenies:an approach using the bootstrap[J].Evolution,1985,39:783-791.
[7]  Fernandes I A,Aguilar J F,Panero J L,et al.A phylogenetic analysis of Doronicum (Asteraceae,Senecioneae)based on morphological,nuclear ribosomal(ITS)and chloroplast (trnL-F)evidence[J].Molecular Phylogenetics and Evolution,2001,20:41-64.
[8]  Garcia J N,Garnatje T,Susanna A,et al.Tribal and subtribal delimitation and phylogeny of the Cardueae(Asteraceae):a combined nuclear and chloroplast DNA analysis[J].Molecular Phylogenetics and Evolution,2002,22:51-64.
[9]  Garcia J N,Susanna A,Mozaffarian V,et al.Generic delimitation and phylogeny of the subtribe Centraureinae(Asteraceae):a combined nuclear and chloroplast DNA analysis[J].Annals of Botany,2001,87:503-515.
[10]  Garcia J N,Susanna A,Mozaffarian V,et al.The natural delimitation of Centaurea (Asteraceae:Cardueae):ITS sequence analysis of the Centaurea jaceagroup[J].Plant Systematics and Evolution,2000,223:185-199.
[11]  Vilatersana R,Susanna A,Garcia N,et al.Genetic delimitation and phylogeny of the Carduncellus-Cartharrus complex(Asteraceae)based on ITS sequences[J].Plant Systematics and Evolution,2000,221:89-105.
[12]  谢航.中国鸢尾有关分类群的讨论及属下分类系统的修订[D].哈尔滨:东北师范大学,1996.
[13]  Demesore B,Sodzi N,Petit R P.A set of universal primers for amplification of polymorphic non-coding regions of mitochondrial and chloroplast DNA in plants[J].Mol Eol,1995,4:129-131.
[14]  田欣,李德铢.DNA序列在植物系统学研究中的应用[J].云南植物研究,2002,24(2):170-184.
[15]  黄瑶.叶绿体DNA及其在植物系统学研究中的应用[J].植物学通报,1994,11(2):11-25.
[16]  卢孟柱,谢红丽,张辉,等.利用叶绿体DNA变异研究胡杨系统发育[J].西北植物学报,2000,20(6):1148-1154.
[17]  汤陵华,孙加祥,宇田津撤朗,等.太湖地区水稻地方品种籼粳分类方法的比较[J].江苏农业学报,2003,19(3):139-144.
[18]  Taberlet P,Gielly L.Universal primers for amplification of three non-coding regions of chloroplast DNA[J].Plant Mol Biol,1991,17:1105-1109.
[19]  卢孟柱,谢红丽,张辉,等.利用叶绿体DNA变异研究胡杨系统发育[J].西北植物学报,2002,20(6):1148-1154.
[20]  Thompson J D,Gibson T J.The Clustal-X windows interface:flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools[J].Nucleic Acids Research,1997,25:4876-4882.

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