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ISSN: 2333-9721
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甘肃河西地区西门塔尔杂交类群NGB基因第4外显子的遗传变异研究

DOI: 10.7668/hbnxb.2015.02.005, PP. 22-27

Keywords: 西门塔尔杂交类群,NGB基因,外显子,遗传变异

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Abstract:

为研究甘肃河西的临泽、甘州、凉州、金昌、高台5个地区西门塔尔杂交类群NGB基因第4外显子的遗传多态性及其变异特征,采用PCR-SSCP方法检测了283头西门塔尔杂交类群NGB基因第4外显子和部分内含子的多态性,并对群体内各等位基因进行了测序。结果显示:5个地区西门塔尔杂交类群共检测出5个等位基因(A、B、C、D、E),表现为6种基因型(AA、BB、AB、AC、AD、AE)。5个地区西门塔尔杂交类群均能检测到AA、BB、AB3种基因型,且甘州、凉州、高台西门塔尔杂交类群还分别检测到AC、AD、AE3种基因型。A等位基因频率在5个群体中最高,为优势等位基因。对不同SSCP带型的对应片段进行测序分析,共发现5个核苷酸突变位点(31bpC→T、68bpG→C和G→A、129bpA→G、207bpC→T),5处突变中仅第207bp处单核苷酸突变落在外显子区域,其余均落在内含子区域,但均未导致氨基酸发生改变。χ2检验结果显示,5个地区西门塔尔杂交类群在第207bp处单核苷酸突变位点上仅凉州、金昌西门塔尔杂交类群处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。群体遗传学分析结果表明,临泽、甘州、凉州、金昌、高台西门塔尔杂交类群的多态信息含量(PIC)分别为0.3582,0.3839,0.4279,0.3682,0.3947,均属于中度多态(0.25

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