基于siRNA-mRNA结合热力学特征的高效siRNA筛选

siRNA与靶标mRNA的相互作用的热力学特征对于其干扰效率至关重要。RNAup是维也纳RNA软件包提供的预测靶标区域的可接触性（accessibility）的软件，将其预测的热力学特征加入到siRNA序列特征里，用支持向量机筛选高效的siRNA，该模型能够很好地预测出高效的siRNA，准确率达到88.12%，敏感度和特异性分别为88.35%和87.94%。