河南省9株狂犬病毒的N基因序列分析

目的分析河南省9株狂犬病毒的核蛋白基因序列，探讨狂犬病毒流行株毒力与致病性的可能变异。方法以RT-nested-PCR扩增9株2006年12月分离于河南省信阳市的狂犬病毒街株，经纯化、克隆、测序后获得9条N基因全长序列，采用生物信息学软件对N基因序列进行分析。结果9株狂犬病毒核蛋白在核苷酸及氨基酸水平上彼此的同源性分别为97.5%~99.3%和98.4%~99.8%；病毒与CTN疫苗的核苷酸序列同源性最高，为88.9%~90.1%，氨基酸序列同源性为97.6%~98.0%；与其他疫苗株相比，9株病毒与其核苷酸及氨基酸同源性范围分别为84.4%~87.9%和94.2%~97.3%；与已知的基因1型狂犬病毒比较，9株病毒核蛋白氨基酸序列发生了若干位点的取代。结论9株河南省狂犬病毒流行株均属基因1型，其核蛋白在基因的核苷酸及推导的氨基酸水平上均有变异，这些变异可能影响疫苗对流行株所致狂犬病的保护效果。