甲型流感病毒血凝素基因的进化与分型研究

目的分析甲型流感病毒各亚型血凝素基因的系统发育特征,探讨甲型流感病毒血凝素基因的起源与演化规律。方法从互联网获取甲型流感16个亚型的基因序列资料,运用DNAStar、ClustalX1.83、MEGA4及PHYLIP3.67等生物信息学软件对其进行系统发育关系研究。结果16个亚型的甲型流感病毒的血凝素基因能够按照各自的血清亚型实现聚类,亚型内各基因的遗传距离在0.10231～0.22516厘摩(centimorgan,cM,SE为0.006～0.011)之间不等,按照系统发育关系,16个血清亚型可以分为5个大的进化簇：亚型H1、H2、H5与H6构成A簇,H8、H9与H12构成B簇,H11、H13与H16构成C簇,H7、H10与H15构成D簇,H3、H4与H14构成E簇,其中A簇、B簇与C簇可进一步聚类为一个进化群,而D簇与E簇也可以进一步聚类为另一进化群。结论按血凝素基因的序列信息可将甲型流感病毒分为5个进化簇并进而分为两个进化群。