翘嘴鳜淀粉酶基因SNPｓ和微卫星位点多态性的检测

本研究主要检测翘嘴鳜淀粉酶（ａｍｙｌａｓｅ，ＡＭＹ）基因的单核苷酸多态性（ｓｉｎｇｌｅｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ，ＳＮＰ）和微卫星位点多态性．实验采用ＰＣＲ产物直接测序法（ＰＣＲｄｉｒｅｃｔｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ，ＰＣＲＤＳ）检测翘嘴鳜ＡＭＹ基因组序列的ＳＮＰｓ和微卫星位点，并使用创造限制酶切位点ＰＣＲ法（ｃｒｅａｔｅｄｒｅｓｔｒｉｃｔｉｏｎｓｉｔｅｓＰＣＲ，ＣＲＳＰＣＲ）和ＰＣＲＤＳ法对ＳＮＰｓ进行分型，应用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测ＡＭＹ基因微卫星位点的多态性．实验结果发现ＡＭＹ基因第１内含子有一个ＳＮＰ位点Ａ１，第５内含子有３个ＳＮＰｓ位点（Ａ２、Ａ３和Ａ４）；此外，第５内含子中还存在一个微卫星位点Ｂ１，共检测到４个等位基因，有９种单倍型．在翘嘴鳜群体中，４个ＳＮＰ位点呈中度遗传多样性，而微卫星位点表现出高度遗传多样性．