巴西橡胶树MADS-27基因的克隆与生物信息学分析

以巴西橡胶树花芽为材料，利用RT-PCR技术从总RNA中扩增获得1个MADS基因。cDNA长度1 063 bp，开放阅读框717 bp，编码239个氨基酸，命名为HbMADS-27。在HbMADS-27氨基酸序列中具有1个较强的跨膜区，二级结构分析结果表明其属于混合型蛋白。HbMADS-27在N端前34～50氨基酸区域内为较强的疏水区，但整条多肽链表现为亲水性。对20个MADS蛋白进行系统进化分析，结果发现，巴西橡胶树的HbMADS-27基因与蓖麻的MADS-27基因亲缘关系最近，而与拟南芥MADS-27基因亲缘关系相对较远。