巴西橡胶树β-木糖苷酶基因的克隆与生物信息学分析

以巴西橡胶树根为材料，利用RT-PCR技术从总RNA中捕获到一个β-木糖苷酶家族基因(β-xylosidase 或β-D-xyloside xylohydrolase，EC 3.2.1.37)，cDNA长度2 880 bp，开放阅读框2 319 bp，编码773个氨基酸，命名为HbEC32。在HbEC32氨基酸序列中具有一个较强的跨膜区，二级结构分析表明其属于混合型蛋白。HbEC32在N端前8～20氨基酸区域内为较强的疏水区，但整条多肽链表现为亲水性。对15个β-木糖苷酶蛋白进行系统进化分析发现，巴西橡胶树的HbEC32基因与蓖麻亲缘关系最近。